2021年6月30日，科睿唯安公布了2020年度《期刊引证报告》，科学出版社出版的501种期刊中，共有97种被SCI收录，32种刊物处于Q1区，影响因子普遍实现较大上升。
科学出版社主办的期刊《国家科学评论》（National Science Review，NSR）影响因子增长到17.275，排名保持在全球综合性期刊第三名，仅次于Nature 和Science。
由《中国科学》杂志社编辑出版的《中国科学》系列期刊，学术指标继续全面提升，影响因子平均涨幅36.1%，《中国科学：信息科学》（SCIENCE CHINA Information Sciences）首次进入Q1区；《科学通报》（Science Bulletin）影响因子突破10，达到11.780。《能源化学》（Journal of Energy Chemistry）影响因子达到9.676，列位全球应用化学类期刊第二名。
科学出版社2019年新并购的法国EDP Sciences 出版的期刊中，有27种被SCI收录，2种期刊位居国际同领域期刊排名Q1区，其中《天文学与天体物理学》（Astronomy & Astrophysics，A&A）是世界三大天文学原创研究论文发表期刊之一，影响因子达到5.802；《自然现象的数学建模》（Mathematical Modelling of Natural Phenomena ，MMNP)影响因子达到4.157，居国际同学科期刊排名前2%。
科学出版社与爱思唯尔合资创办的科爱公司共有17种期刊获得影响因子，13种期刊处于Q1区，9种期刊位居世界同学科前五名。其中，《生物活性材料》（Bioactive Materials）影响因子达到14.593，《镁合金》（Journal of Magnesium and Alloys）影响因子达到10.088，均居同领域学术期刊第一名。
作为国家级的科技期刊出版基地，科学出版社积极贯彻落实《关于深化改革 培育世界一流科技期刊的意见》等文件精神，加快推动中国科技期刊卓越行动计划各项目的实施，坚持以“精品化、国际化、集群化、数字化、专业化”的总体思路推动科技期刊业务加快发展，打造了以SciEngine为代表的一系列期刊技术平台，致力于推动科技期刊集群化发展，提升中国科技期刊的国际影响力和传播力。
